ارزیابی روش Real-time PCR Multiplex به‌منظور شناسایی گونه‌های شایع باکتری بروسلا

Authors

  • بهمنی, نسرین دانشجوی دکترای تخصصی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات بروسلوز، گروه میکروبشناسی، همدان، ایران
  • عربستانی, محمد رضا دانشیار، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات بروسلوز، گروه میکروبشناسی، همدان، ایران
  • علیخانی, محمد یوسف استاد، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات بروسلوز، گروه میکروبشناسی، همدان، ایران
  • غلامی, علی کارشناسی ارشد، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، گروه میکروبشناسی، همدان، ایران
  • هاشمی, حمید استاد، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، مرکز تحقیقات بروسلوز، گروه میکروبشناسی، همدان، ایران
Abstract:

Background and purpose: Brucellosis is a zoonotic disease. Given that serologic test has some specific characteristics such as difficult growth, problems associated with culture, and cross-reactions with otherbacteria, in this study multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) method was used to detect the most common species of Brucella spp. Materials and methods: This experimental study was performed in Hamedan University of Medical Sciences, Hamedan, Iran, 2015, in two bioinformatical and analytical stages. A universal primer was designed to detect Brucella genus and two primers were prepared for B. melitensis and B. abortus, which are the most common species. The target genes for universal Brucella, B. melitensis, and B. abortus primers were ITS, BMEII-0466, and BruAB2-0168, respectively. In the analytical stage, specificity and sensitivity of the primers were evaluated. Results: In this study, the universal primer of Brucella was detected in 83 bp at melt temperature of 82∘C. Moreover, B. melitensis and B. abortus primers were specifically identified in 121 bp and 285 bp at melt tempretures of 84∘C and 87∘C, respectively. The sensitivity for the universal Brucella primer and B. abortus was 50 fg, while it was 100 fg for the B. melitensis primer. Conclusion: The identified primers revealed high levels of sensitivity and specificity. Therefore, they can be considered along with culture in clinical trials.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

ارزیابی روش real-time pcr multiplex به منظور شناسایی گونه های شایع باکتری بروسلا

سابقه و هدف: بیماری بروسلوز یک بیماری مشترک انسان و دام است. با توجه به ویژگی هایی مانند سخت رشد بودن، خطرات مرتبط با کشت و وجود واکنش های متقاطع با باکتری های دیگر در آزمون سرولوژیک، در مطالعه حاضر روش real-time pcr multiplex به منظور شناسایی گونه های شایع باکتری بروسلا (brucella) ارزیابی شد. مواد و روش ها: این مطالعه تجربی در دانشگاه علوم پزشکی همدان و در سال 1394 در دو مرحله بیوانفورماتیکی و...

full text

Real-time multiplex PCR assays.

The ability to multiplex PCR by probe color and melting temperature (T(m)) greatly expands the power of real-time analysis. Simple hybridization probes with only a single fluorescent dye can be used for quantification and allele typing. Different probes are labeled with dyes that have unique emission spectra. Spectral data are collected with discrete optics or dispersed onto an array for detect...

full text

راه اندازی روش اختصاصی و حساس Real-Time PCR به منظور تشخیص گونه های بروسلا

 مقدمه و هدف: بروسلوز یک بیماری مشترک بین انسان و دام ویک مشکل بهداشت عمومی در سراسر جهان می باشد.بروسلوز باعث سقط جنین ،اختلالات باروری ،عفونت های تناسلی،کاهش شیر،اورتریت و اپیدیدیمیت در میزبان اصلی می شود و از این جهت باعث عوارض مزمن و تحمیل هزینه های درمانی فراوان به بیماران و ضررهای اقتصادی زیاد به دامداران می گردد.این بیماری،در تمام نقاط ایران پراکنده است و ایران یکی ازمناطق آندمیک آل...

full text

تشخیص بروسلا ملیتنسیس به روش real-time pcr در نمونه های بالینی و دامی

جنس بروسلا، باکتری های درون سلولی اختیاری هستند که باعث ایجاد بیماری بروسلوزیس در انسان و دام می شوند. روش های تشخیصی مبتنی بر کشت با وجود آنکه استاندارد طلایی محسوب می شوند، حساسیت پایینی (تا 70%) دارند. آزمون های سرولوژیکی به دلیل ایجاد واکنش های متقاطع با سایر میکروارگانیسم ها و نبود الگوهای مناسب جهت تفسیر تیتر های آنتی بادی در مناطق اندمیک، قادر به رفع مشلات پیش روی تشخیص این بیماری نیستند...

15 صفحه اول

Key words: herpes simplex virus, real-time PCR, multiplex real-time PCR assay

要 旨 単 純 ヘ ル ペ ス ウ イ ル ス1型(HSV-1)お よ び2型(HSV-2)の 遺 伝 子 を 同時 に検 出 す るmultiplex real-time PCR法 を 開発 し た. HSV-1お よびHSV-2のgpD領 域 を標 的 と し,プ ラ イ マ ー お よ びTaqMan蛍 光 プ ロ ー ブ を 独 自 に 設 計 し た.検 出感 度 は15copies/tubeで,HSV-1お よ びHSV-2と も15か ら1.5×106 copies/tubeの 範 囲 で 定 量 が 可 能 で あ っ た.real-time PCR法 はPCR法 よ り も103倍 感 度 が 高 く,他 の ヘ ルペ ス属(CMV, EBV, HHV6, HHV-7お よ びVZV) DNAは 検 出 され なか っ た. 以 上 の結 果 か ら,今 回 開 発...

full text

Authentication of male beef by multiplex fast real-time PCR.

Meat is a significant source of high-quality nutrients, which are very important in the diet. Among meat products, one of the most prized is bovine meat, of which male beef has been designated to be of a higher quality. However, because of its similarity with female beef, deliberate or unintentional substitutions can occur. To avoid this, methodology based on the fast real-time polymerase chain...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 27  issue 147

pages  97- 107

publication date 2017-04

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023